{"id":5032,"date":"2020-04-29T13:49:29","date_gmt":"2020-04-29T11:49:29","guid":{"rendered":"http:\/\/marburg.news\/?p=5032"},"modified":"2020-04-29T13:49:29","modified_gmt":"2020-04-29T11:49:29","slug":"leichte-information-datenbank-hilft-bei-entwicklung-von-corona-impfstoffen","status":"publish","type":"post","link":"http:\/\/marburg.news\/?p=5032","title":{"rendered":"Leichte Information: Datenbank hilft bei Entwicklung von Corona-Impfstoffen"},"content":{"rendered":"

Eine neue Marburger Datenbank hilft im Kampf gegen die Corona-Pandemie. Der Fachbereich Mathematik und Informatik entwickelt eine biomedizinische Datenbank f\u00fcr die Arzneimittelentwicklung gegen SARS-CoV-2.
\nWissenschaftlerinnen und Wissenschaftler auf der ganzen Welt befassen sich derzeit mit der Suche nach einem Medikament gegen das Virus SARS-CoV-2. Dabei werden die Forschungsteams ab sofort durch eine neue Datenbank unterst\u00fctzt, die am Fachbereich Mathematik und Informatik der Philipps-Universit\u00e4t entwickelt wurde. Die Datenbank „CORona Drug InTEractions database“ (CORDITE) b\u00fcndelt zentrale Forschungsdaten zu SARS-CoV-2 und bietet damit eine wichtige Hilfestellung f\u00fcr die Arzneimittelentwicklung.
\nBevor ein neuer Wirkstoff eingesetzt werden kann, muss er zun\u00e4chst in Simulationen identifiziert und in zellbasierten Verfahren untersucht werden. Dabei werden potenzielle Zielstrukturen und Andockstellen auf Zellen –
\nsogenannte „Targets“ – analysiert. „CORDITE b\u00fcndelt Daten aus \u00fcber 230 Publikationen und mehr als 240 klinischen Studien weltweit.
\nDas sind Daten zu fast 600 Arzneimittelinteraktionen f\u00fcr 20 Targets und f\u00fcr mehr als 450 Medikamente. „Damit ist sie derzeit die gr\u00f6\u00dfte kuratierte Datenbank f\u00fcr potentielle Medikamente f\u00fcr SARS-CoV-2“, erkl\u00e4rte Prof. Dr. Dominik Heider. Er ist Leiter der Arbeitsgruppe „Data Science in der Biomedizin“ am Fachbereich Mathematik und Informatik der Philipps-Universit\u00e4t, die CORDITE entwickelt hat. „CORDITE“ b\u00fcndelt automatisch Informationen \u00fcber rechnergest\u00fctzte, in vitro-
\noder Fallstudien zu potenziellen Medikamenten f\u00fcr die Bek\u00e4mpfung von SARS-CoV-2 beziehungsweise COVID 19 der Fachdatenbanken PubMed, bioRxiv, chemRxiv und medRxiv – neben Originalarbeiten auch \u00dcbersichtsarbeiten und Kommentare. Dar\u00fcber hinaus werden auch registrierte klinische Studien des National Institutes for Health (NIH) gelistet.
\nNutzerinnen und Nutzer k\u00f6nnen auf relevante Daten zugreifen, nach verschiedenen Kriterien sortieren und herunterladen. „So k\u00f6nnen Forscherinnen und Forscher Meta-Analysen durchf\u00fchren, neue klinische Studien entwerfen oder sogar eine kuratierte Literatursuche durchf\u00fchren. Auch die Integration in andere Software oder Apps ist m\u00f6glich“, sagt Heider. Die Informationen aus den Artikeln und Preprints werden von Moderatorinnen und Moderatoren der Arbeitsgruppe manuell kuratiert.
\nHauptaugenmerk der Arbeitsgruppe „Data Science in der Biomedizin“ am Fachbereich Mathematik und Informatik der Philipps-Universit\u00e4t liegt auf der Entwicklung von Computerl\u00f6sungen aus dem Bereich der Datenwissenschaft zur L\u00f6sung biomedizinischer Probleme. Sie erstellt zum Beispiel Algorithmen f\u00fcr maschinelles Lernen zur Vorhersage der Arzneimittelresistenz von Krankheitserregern oder zur Modellierung von Krankheiten. Der Zugriff auf „CORDITE“ erfolgt \u00fcber cordite.mathematik.uni-marburg.de<\/a>.<\/p>\n

* pm: Philipps-Universit\u00e4t Marburg<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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